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大豆NF-YB家族全基因组鉴定、分类和表达
郑炜君; 徐兆师; 冯志娟; 李连城; 陈明; 柴守诚; 马有志
2012-09-12
发表期刊作物学报
期号09页码:1570-1582
摘要利用大豆基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定大豆NF-YB家族基因的全序列、定位和拷贝数,通过序列比对进行进化和分类分析。利用大豆高通量RNA测序数据、NCBI中UniGene的EST表达数据进行组织表达谱分析。结果表明,大豆基因组中含有28个NF-YB家族基因,分布于大豆的14条染色体上,系统进化树分析将其分成3类。启动子分析表明,几乎全部NF-YB家族基因的启动子区均含有逆境应答反应顺式作用元件。各个发育阶段中,多数成员至少在一个组织中表达,10个差异表达的基因中有2个在根瘤中特异表达,2个在根中特异表达,2个在根瘤中优势表达,另外4个在其他部位优势表达。研究结果促进了NF-YB家族基因...
关键词NF-YB家族 全基因组鉴定 进化 差异表达 启动子
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语种中文
项目资助信息国家自然科学基金项目(31171546);;国家转基因生物新品种培育科技重大专项(2011ZX08002-002,2009ZX08009-083B)资助
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文献类型期刊论文
条目标识符http://ir.nais.net.cn/handle/2HMLN22E/131844
专题作物科学研究所_分子生物学系
作者单位西北农林科技大学农学院;中国农业科学院作物科学研究所/农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程/农业部作物遗传育种重点开放实验室
推荐引用方式
GB/T 7714
郑炜君,徐兆师,冯志娟,等. 大豆NF-YB家族全基因组鉴定、分类和表达[J]. 作物学报,2012(09):1570-1582.
APA 郑炜君.,徐兆师.,冯志娟.,李连城.,陈明.,...&马有志.(2012).大豆NF-YB家族全基因组鉴定、分类和表达.作物学报(09),1570-1582.
MLA 郑炜君,et al."大豆NF-YB家族全基因组鉴定、分类和表达".作物学报 .09(2012):1570-1582.
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